短效口服避孕药和紧急避孕药是两类作用机理和适用人群有很大区别的避孕药物，分别适用于不同的避孕需求和场合。短效口服避孕药适用于所有存在避孕需求的健康育龄妇女，是目前世界上应用最广泛，可靠性最高的常规避孕方式之一。紧急避孕药是一种可以作为无防护性行为事后补救的措施。
适用人群不同 短效口服避孕药每日一片，每个生理周期内连续服用21天，可长期使用。在正确使用的情况下，可实现有效率99%以上的可靠避孕效果，适合健康育龄妇女作为日常避孕的选择。紧急避孕药是一种事后的补救方式。女性在遭受意外伤害、进行了无防护性生活，或其他避孕方式失败等情况下，可在事后72小时内服用以避免意外怀孕，但不可作为日常避孕手段。
避孕效果不同 作为一种常规避孕方式，短效口服避孕药雌激素、孕激素共同作用，只要正确服用，避孕率可达99%以上，非常适合常规避孕。紧急避孕药主要针对无防护性行为或遭到性暴力的事后避孕需求，大量孕激素作用可达到的避孕率为80%~85%，但不适合作为常规避孕方式。
安全性不同 作为一种成熟的避孕方式，短效口服避孕药可帮助女性维持规律的月经周期，降低某些妇科疾病的发病几率，并对卵巢癌和子宫体癌也具有一定的预防作用。短效口服避孕药不会影响生育和后代发育。另外，高选择性孕激素，特别是第四代含有屈螺酮的口服避孕药的出现，让短效口服避孕药的安全性得到了进一步提升。屈螺酮具有抗盐皮质激素活性，能够对抗水钠潴留引起的体重增加，从而有效控制甚至减轻体重，不会出现以往长期使用口服避孕药时引起发胖的现象。
相比较，紧急避孕药因为含有大量孕激素，使用一次其激素使用量一般相当于8天的短效口服避孕药量。大剂量的外来激素容易造成女性内分泌紊乱，导致月经周期改变。过分依赖紧急避孕药，还可能引起新生儿畸形发生率升高、女性不孕等后果。
避孕外益处 随着新型孕激素的出现，短效避孕药除具有良好的避孕效果外，还具有了更多避孕外益处。含有屈螺酮的新一代短效口服避孕药优思明可有效缓解乳房胀痛、手指浮肿、紧张、易怒等经前期综合征。另外，因其具有抗雄激素效应，对因雄激素过高而引起的痤疮现象也有明显的改善作用，能够令使用者皮肤光洁。
