临床上，约80% 的习惯性流产与免疫异常有关。也就是说，怀孕期女方体内产生了针对男方的免疫反应，导致胚胎无法在母亲体内存活，引起了流产。免疫病因分类必须正确，才能选择更高效的治疗方案。对患者来说，耐心等待、配合检查就非常重要。如果在流产后身体没有完全恢复的情况下就开始免疫检查，各项指标都没有达到稳定状况，不能反映真实的情况。
需要检查的项目：
内分泌因素基有基础体温，血雌激素、孕激素，泌乳素等；感染因素有白带检查、弓形虫、支原体、衣原体、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、风疹病毒等；生殖器因素有子宫输卵管造影、宫腔镜检查等；遗传因素夫妇双方染色体核型分析；免疫因素有透明带抗体，磷脂抗体，ABO血型抗体，封闭抗体，封闭抗体抗独特型抗体等。注意以上检查在除外男方精液异常后进行。
免疫病因分三类。
免疫检查的项目非常复杂，很多患者抱怨，看不懂检查结果，有些人则简单地认为抗体指标“阳性”就是糟糕，“阴性”就说明没问题，实际远没那么简单。这里只能选择两项比较重要的检查简要分析，更详细的情况还要听取医生的当面解释。
封闭抗体缺乏是习惯性流产的主要病因。
封闭抗体是一种混合抗体，存在于正常孕妇的血清中，80-90%习惯性流产的妇女测不到这种抗体。妊娠时，母体可产生致敏T细胞，它能破坏胚胎细胞，但致敏T细胞的杀伤功能可被封闭抗体所抑制。然而习惯性流产患者体内由于缺乏这种抗体，存在未被抑制的细胞毒细胞，这些细胞直接作用于胚胎，或通过释放炎性介质间接损害胎儿或胎盘，从而导致了流产。
抗心磷脂抗体——能否再次怀孕的指标。
我们对习惯性流产的患者，常规建议作抗心磷脂抗体检测及免疫相关检查，以决定是否适宜怀孕。如果抗心磷脂抗体阴性，患者可以怀孕；如果抗心磷脂抗体阳性，说明可能存在抗磷脂综合征，由于反复发作的血液高凝状态、血栓形成、血小板减少，导致反复发生流产或死胎。
临床上，免疫性流产按病因可分三大类，治疗方法也不同。
1、母－胎免疫识别低下型：主要呈现封闭抗体缺乏，配偶白细胞主动免疫疗法、静脉免疫球蛋白被动免疫疗法。
2、母－胎免疫识别过度型：包括自身免疫异常（如透明带抗体、磷脂抗体等阳性）及同种免疫异常（母－胎ABO血型不合）以免疫抑制剂为主。
3、母－胎免疫识别紊乱型：一方面表现为封闭抗体缺乏，另一方面表现出免疫损伤作用异常增高。治疗上十分棘手，方案还有待探索。
