术时并发症：子宫出血在200毫升以上；人流综合征又称心脑综合征，发生率12%，受术者突然出现心动过缓，心律失常，血压下降，面色苍白，大汗淋漓等一系列症状，严重者甚至发生昏厥和抽搐；子宫穿孔；漏吸，胚胎组织未能吸出，以至妊娠继续发展。
近期并发症：人工流产不全，术后阴道出血长达15天以上；术后 2周内由于致病菌的感染而出现子宫内膜炎，附件炎，盆腔炎等；宫腔积血；宫腔粘连，术后闭经或经量显著减少，有时伴周期性下腹疼痛或有子宫增大积血。
远期并发症：慢性盆腔炎；月经异常；继发不孕；子宫内膜异位症。
再次妊娠时的并发症：不孕症；晚期流产偏高；早产偏高；围生期死亡率偏高；产前、产后出血率增加；新生儿溶血症增加。
药物流产适用于停经49天内的妇女。国产米非司酮的不全流产和流产失败率约10%；药物流产的副作用有恶心，呕吐，头晕和乏力等类早孕反应，下腹痛明显增高；药物流产后出血时间长，平均为半个月左右，有的长达1-2个月之久，并有潜在大出血的危险；在进行药物流产中，部分孕妇停经在40天之内，此时临床难以确诊是宫外还是宫内妊娠，因此有时误诊而使用药物流产，以后发生内出血休克需要抢救。
药物流产只能是避孕失败的补救措施之一，绝不能以药物流产当作避孕措施。
